학술정보원 조직은 업무를 총괄하는 원장, 학술정보원 운영위원회 학술정보운영팀으로 구성되어있다.
학술정보운영팀은 학술정보원 자료의 선정과 구입, 자료교환, 예산회계 및 도서의 분류, 목록 등 도서정리에 관한 업무를 담당하며 도서의 대출 및 반납, 제본수리, 장서의 관리, 보존 등을 분장하고 참고봉사자료의 색인목록을 관리하며 도서관 자료의 이용통계와 장서점검, 정보수집의 제공에 관한 업무를 담당하고 있다.
